SS назначьте любым. PB5 убирать смысла нет - он уже не reset, вернуть назад без fusebit doctor не получится. А работает в любом случае от внутреннего генератора, только там как то заумно сделано.
Платы Digispark работают на частоте 16 или 16,5МГц. Ее источником служит PLL генератор: тактовый сигнал от внутреннего калиброванного RC-генератора (~8МГц) подается на вход умножителя на 8, в результате получается частота 64МГц, затем она делится на 4, что дает системную частоту 16МГц. При подключении Digispark к компьютеру загрузчик калибрует RC-генератор для получения системной частоты 16,5МГц. Начиная с версии загрузчика 1.0.6 калибровочная информация сохраняется внутри микроконтроллера. Предыдущие версии загрузчика этого не делали, поэтому при работе от внешнего источника питания (не от шины USB) такие платы работают на частоте 16МГц.
Тут подробней
https://tsibrov.blogspot.com/2018/12/digispark.html